Предприятие возглавляет директор, который руководит производственно-хозяйственной и финансово-экономической деятельностью предприятия в соответствии с действующим законодательством. Отвечает за результаты принятых решений, сохранение и эффективное использование имущества предприятия, а также финансово-хозяйственные результаты его деятельности.

Главный инженер определяет техническую политику и направления технического развития предприятия, пути реконструкции и технического перевооружения производства, обеспечивает бесперебойную техническую эксплуатацию и надежную работу всех систем водоснабжения и водоотведения с учетом требований охраны водоемов от загрязнения сточными водами и рациональным использованием водных ресурсов.

Аварийно-диспетчерская служба осуществляет оперативное управление эксплуатацией систем водопотребления и водоотведения, дистанционное управление и видеонаблюдение за объектами, переведенными в режим диспетчеризации и автоматизации, публикацию на официальном вебсайте предприятия оперативной информации об аварийных ситуациях и их устранении, принимает срочные меры для локализации и ликвидации аварий и повреждений в системе водопроводно-канализационного хозяйства.

Производственно-технический отдел координирует производственно-техническую деятельность предприятия, занимается разработкой и осуществлением технических мероприятий, направленных на повышение качества и эффективности производства, осуществляет контроль за производственной деятельностью структурных подразделений и выполнением производственных задач и программ; подготовку и выдачу технических условий на подключение к городским сетям водоснабжения и канализации, согласование проектной документации, обеспечение ежегодной разработки, согласование и утверждение инвестиционной программы. Создание условий для безаварийной эксплуатации зданий и сооружений, организация работы по текущему ремонту и реконструкции, обеспечение технического надзора за состоянием зданий и сооружений при их эксплуатации возложено на ремонтно-строительную бригаду.

Производственное руководство по обеспечению потребителей качественной питьевой водой возложено на службу водоснабжения.

Производственное руководство организацией водоотведения и очистки сточных вод возложено на службу канализационных очистных сооружений (водоотведения).

Организацию работы по содержанию водопроводных и канализационных сетей и ликвидации аварийных ситуаций осуществляют служба водопроводных сетей и служба канализационных сетей и канализационных насосных станций.

Контроль качества питьевой воды и сточных вод осуществляют производственно-измерительные лаборатории водоснабжения и водоотведения.

Отдел главного энергетика обеспечивает бесперебойную поставку предприятию всех видов энергии, развитие энергетического хозяйства, надлежащее техническое состояние и рациональную эксплуатацию энергетического оборудования, энергетических установок и коммуникаций; обеспечивает бесперебойную техническую эксплуатацию систем автоматизации и диспетчеризации, охранной сигнализации, контрольно-измерительных приборов и автоматики, метрологического и электрического оборудования, организацию подготовки счетчиков воды к периодической поверке на стационарной проливной установке.

Отдел главного механика обеспечивает бесперебойную техническую эксплуатацию и своевременный ремонт производственного, технологического (насосного, металлорежущего, подъемно-транспортного) оборудования, машин и механизмов.

Участок механизации осуществляет транспортное обеспечение перевозок, обеспечивает бесперебойную и технически верную безопасную эксплуатацию, надежную работу, содержание в работоспособном состоянии, эффективное использование автотранспортной и тракторной техники.

Отдел охраны окружающей среды обеспечивает контроль соблюдения экологических норм и правил, осуществляет контроль качества питьевой воды, поступающей на очистные сооружения и подается в распределительную сеть города Бердянск.

Учет реализации услуг и сбора платежей за предоставленные потребителям услуги по водоснабжению и водоотведению, осуществление работы с абонентами-должниками, предоставление качественного доступного сервиса, направленного на удовлетворение потребностей потребителей, обеспечивает отдел абонентского обслуживания и колл-центр. Контролирует соблюдение потребителями Правил предоставления услуг централизованного водоснабжения и водоотведения, Правил пользования системами централизованного коммунального водоснабжения и водоотведения, законодательства о питьевом водоснабжении и водоотведении, проводит мероприятия по снижению потерь воды, выявляет нарушения потребителями законодательных требований.

Отдел информационных технологий решает вопросы использования и внедрения на предприятии программного обеспечения и компьютерной техники, обеспечения функционирования официального веб-сайта, организации предоставления доступа к сети Интернет.

Бухгалтерия определяет учетную политику предприятия, обеспечивает ведение бухгалтерского учета финансово-хозяйственной деятельности, движение денежных средств, организацию инвентаризационной работы на предприятии.

Организация правовой работы, претензионно-исковая работа, заключение договоров и контроль за исполнением договорных обязательств, оформление договорных отношений с потребителями услуг, обеспечение соблюдения на предприятии требований законодательства о публичных закупках, представление интересов предприятия при рассмотрении судебных дел возложено на юридический отдел.

Отдел кадров возглавляет работу по обеспечению предприятия работниками необходимых профессий, специальностей и квалификаций в соответствии с целями, стратегией и профилем предприятия, внешними и внутренними условиями его деятельности, ведение учета по пенсионерам и инвалидам; осуществляет организацию делопроизводства и документооборота на предприятии, обеспечение единого порядка работы с документами, контроля соблюдения сроков выполнения документов.

Служба охраны труда организовывает и координирует работы по охране труда на предприятии, осуществляет контроль за соблюдением в структурных подразделениях законодательных и нормативно-правовых актов по охране труда, проведением профилактической работы по предупреждению производственного травматизма, профессиональных и производственно-обусловленных заболеваний, мер по созданию здоровых и безопасных условий труда на предприятии, по предоставлению работникам установленных льгот и компенсаций согласно условиям труда.

Функции анализа финансово-хозяйственной деятельности, планирования объемов предоставления услуг, расчетов тарифов (цен) на услуги предприятия, организации труда и заработной платы возложены на службу ценообразования, планирования и экономического анализа.

Отдел материально-технического снабжения осуществляет обеспечение предприятия всеми необходимыми материальными ресурсами и услугами специализированных предприятий, организацию складского хозяйства.

Невоенизированная охрана осуществляет охрану объектов и материальных ценностей предприятия, обеспечивает пропускной режим на КПП работников, посетителей, транспортных средств и грузов, а также предотвращение несанкционированного перемещения материальных средств, недопущение их хищения и проникновения посторонних лиц на объекты.

Права, обязанности и ответственность работников аппарата управления, руководителей и специалистов структурных подразделений определены должностными инструкциями.